Protein–RNA interactions for Protein: Q16563

SYPL1, Synaptophysin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYPL1Q16563 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYPL1Q16563 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYPL1Q16563 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYPL1Q16563 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SYPL1Q16563 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYPL1Q16563 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SYPL1Q16563 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYPL1Q16563 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYPL1Q16563 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYPL1Q16563 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYPL1Q16563 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SYPL1Q16563 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SYPL1Q16563 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYPL1Q16563 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYPL1Q16563 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYPL1Q16563 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYPL1Q16563 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYPL1Q16563 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYPL1Q16563 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYPL1Q16563 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYPL1Q16563 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYPL1Q16563 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYPL1Q16563 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYPL1Q16563 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYPL1Q16563 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYPL1Q16563 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYPL1Q16563 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYPL1Q16563 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYPL1Q16563 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYPL1Q16563 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYPL1Q16563 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYPL1Q16563 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYPL1Q16563 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYPL1Q16563 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYPL1Q16563 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYPL1Q16563 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYPL1Q16563 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYPL1Q16563 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYPL1Q16563 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYPL1Q16563 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYPL1Q16563 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYPL1Q16563 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYPL1Q16563 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYPL1Q16563 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYPL1Q16563 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYPL1Q16563 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYPL1Q16563 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYPL1Q16563 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYPL1Q16563 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYPL1Q16563 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYPL1Q16563 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYPL1Q16563 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYPL1Q16563 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYPL1Q16563 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYPL1Q16563 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYPL1Q16563 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYPL1Q16563 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYPL1Q16563 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYPL1Q16563 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYPL1Q16563 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYPL1Q16563 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYPL1Q16563 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYPL1Q16563 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYPL1Q16563 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYPL1Q16563 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYPL1Q16563 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYPL1Q16563 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYPL1Q16563 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYPL1Q16563 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYPL1Q16563 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYPL1Q16563 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYPL1Q16563 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYPL1Q16563 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYPL1Q16563 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SYPL1Q16563 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYPL1Q16563 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYPL1Q16563 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYPL1Q16563 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SYPL1Q16563 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYPL1Q16563 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYPL1Q16563 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYPL1Q16563 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYPL1Q16563 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYPL1Q16563 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYPL1Q16563 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYPL1Q16563 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYPL1Q16563 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYPL1Q16563 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYPL1Q16563 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYPL1Q16563 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SYPL1Q16563 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYPL1Q16563 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYPL1Q16563 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYPL1Q16563 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYPL1Q16563 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SYPL1Q16563 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SYPL1Q16563 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SYPL1Q16563 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SYPL1Q16563 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SYPL1Q16563 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms