Protein–RNA interactions for Protein: Q16543

CDC37, Hsp90 co-chaperone Cdc37, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 378 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC37Q16543 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CDC37Q16543 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CDC37Q16543 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CDC37Q16543 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CDC37Q16543 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CDC37Q16543 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CDC37Q16543 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CDC37Q16543 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
CDC37Q16543 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CDC37Q16543 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CDC37Q16543 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CDC37Q16543 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CDC37Q16543 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CDC37Q16543 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CDC37Q16543 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CDC37Q16543 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CDC37Q16543 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CDC37Q16543 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CDC37Q16543 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CDC37Q16543 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CDC37Q16543 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CDC37Q16543 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
CDC37Q16543 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CDC37Q16543 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CDC37Q16543 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CDC37Q16543 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CDC37Q16543 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
CDC37Q16543 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
CDC37Q16543 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CDC37Q16543 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
CDC37Q16543 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CDC37Q16543 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CDC37Q16543 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CDC37Q16543 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CDC37Q16543 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CDC37Q16543 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CDC37Q16543 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CDC37Q16543 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CDC37Q16543 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CDC37Q16543 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CDC37Q16543 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CDC37Q16543 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CDC37Q16543 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
CDC37Q16543 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CDC37Q16543 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CDC37Q16543 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CDC37Q16543 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CDC37Q16543 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CDC37Q16543 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CDC37Q16543 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CDC37Q16543 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CDC37Q16543 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CDC37Q16543 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CDC37Q16543 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CDC37Q16543 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CDC37Q16543 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CDC37Q16543 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CDC37Q16543 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
CDC37Q16543 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CDC37Q16543 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CDC37Q16543 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CDC37Q16543 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CDC37Q16543 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CDC37Q16543 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CDC37Q16543 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CDC37Q16543 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
CDC37Q16543 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CDC37Q16543 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CDC37Q16543 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CDC37Q16543 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CDC37Q16543 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CDC37Q16543 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CDC37Q16543 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CDC37Q16543 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CDC37Q16543 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CDC37Q16543 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CDC37Q16543 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CDC37Q16543 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CDC37Q16543 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CDC37Q16543 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CDC37Q16543 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CDC37Q16543 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CDC37Q16543 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CDC37Q16543 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
CDC37Q16543 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CDC37Q16543 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CDC37Q16543 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CDC37Q16543 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CDC37Q16543 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CDC37Q16543 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
CDC37Q16543 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CDC37Q16543 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CDC37Q16543 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CDC37Q16543 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CDC37Q16543 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CDC37Q16543 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CDC37Q16543 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CDC37Q16543 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CDC37Q16543 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CDC37Q16543 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
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