Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
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SNCBQ16143 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
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SNCBQ16143 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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SNCBQ16143 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
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SNCBQ16143 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
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