Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP6AP1Q15904 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms