Protein–RNA interactions for Protein: Q15768

EFNB3, Ephrin-B3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB3Q15768 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFNB3Q15768 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFNB3Q15768 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFNB3Q15768 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFNB3Q15768 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFNB3Q15768 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFNB3Q15768 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFNB3Q15768 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFNB3Q15768 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFNB3Q15768 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFNB3Q15768 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFNB3Q15768 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
EFNB3Q15768 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFNB3Q15768 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
EFNB3Q15768 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
EFNB3Q15768 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFNB3Q15768 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFNB3Q15768 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFNB3Q15768 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
EFNB3Q15768 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFNB3Q15768 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFNB3Q15768 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFNB3Q15768 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFNB3Q15768 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFNB3Q15768 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFNB3Q15768 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFNB3Q15768 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFNB3Q15768 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFNB3Q15768 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNB3Q15768 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNB3Q15768 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNB3Q15768 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNB3Q15768 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNB3Q15768 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNB3Q15768 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNB3Q15768 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNB3Q15768 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNB3Q15768 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNB3Q15768 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNB3Q15768 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNB3Q15768 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNB3Q15768 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNB3Q15768 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNB3Q15768 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNB3Q15768 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNB3Q15768 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNB3Q15768 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNB3Q15768 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNB3Q15768 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNB3Q15768 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
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EFNB3Q15768 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNB3Q15768 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNB3Q15768 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNB3Q15768 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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EFNB3Q15768 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNB3Q15768 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNB3Q15768 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNB3Q15768 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNB3Q15768 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNB3Q15768 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNB3Q15768 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNB3Q15768 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNB3Q15768 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNB3Q15768 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNB3Q15768 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNB3Q15768 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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EFNB3Q15768 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNB3Q15768 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNB3Q15768 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
EFNB3Q15768 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
EFNB3Q15768 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
EFNB3Q15768 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
EFNB3Q15768 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
EFNB3Q15768 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
EFNB3Q15768 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
EFNB3Q15768 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
EFNB3Q15768 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
EFNB3Q15768 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
EFNB3Q15768 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
EFNB3Q15768 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
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