Protein–RNA interactions for Protein: Q15650

TRIP4, Activating signal cointegrator 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP4Q15650 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
TRIP4Q15650 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRIP4Q15650 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms