Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms