Protein–RNA interactions for Protein: Q15276

RABEP1, Rab GTPase-binding effector protein 1, humanhuman

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Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABEP1Q15276 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RABEP1Q15276 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
RABEP1Q15276 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
RABEP1Q15276 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
RABEP1Q15276 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RABEP1Q15276 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RABEP1Q15276 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RABEP1Q15276 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RABEP1Q15276 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RABEP1Q15276 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
RABEP1Q15276 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
RABEP1Q15276 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
RABEP1Q15276 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
RABEP1Q15276 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
RABEP1Q15276 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
RABEP1Q15276 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
RABEP1Q15276 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RABEP1Q15276 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RABEP1Q15276 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RABEP1Q15276 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RABEP1Q15276 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RABEP1Q15276 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RABEP1Q15276 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RABEP1Q15276 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RABEP1Q15276 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RABEP1Q15276 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RABEP1Q15276 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RABEP1Q15276 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RABEP1Q15276 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RABEP1Q15276 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RABEP1Q15276 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RABEP1Q15276 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RABEP1Q15276 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RABEP1Q15276 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RABEP1Q15276 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RABEP1Q15276 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RABEP1Q15276 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
RABEP1Q15276 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RABEP1Q15276 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RABEP1Q15276 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RABEP1Q15276 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RABEP1Q15276 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RABEP1Q15276 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RABEP1Q15276 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RABEP1Q15276 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RABEP1Q15276 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RABEP1Q15276 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RABEP1Q15276 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RABEP1Q15276 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RABEP1Q15276 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RABEP1Q15276 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RABEP1Q15276 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RABEP1Q15276 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RABEP1Q15276 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RABEP1Q15276 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RABEP1Q15276 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RABEP1Q15276 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RABEP1Q15276 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RABEP1Q15276 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RABEP1Q15276 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RABEP1Q15276 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RABEP1Q15276 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RABEP1Q15276 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RABEP1Q15276 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RABEP1Q15276 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RABEP1Q15276 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RABEP1Q15276 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RABEP1Q15276 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RABEP1Q15276 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RABEP1Q15276 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RABEP1Q15276 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RABEP1Q15276 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RABEP1Q15276 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RABEP1Q15276 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RABEP1Q15276 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RABEP1Q15276 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RABEP1Q15276 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RABEP1Q15276 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RABEP1Q15276 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RABEP1Q15276 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RABEP1Q15276 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RABEP1Q15276 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RABEP1Q15276 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RABEP1Q15276 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RABEP1Q15276 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RABEP1Q15276 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RABEP1Q15276 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RABEP1Q15276 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RABEP1Q15276 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RABEP1Q15276 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RABEP1Q15276 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RABEP1Q15276 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RABEP1Q15276 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RABEP1Q15276 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RABEP1Q15276 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RABEP1Q15276 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RABEP1Q15276 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RABEP1Q15276 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RABEP1Q15276 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RABEP1Q15276 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
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