Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

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Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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