Protein–RNA interactions for Protein: Q15052

ARHGEF6, Rho guanine nucleotide exchange factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF6Q15052 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ARHGEF6Q15052 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ARHGEF6Q15052 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ARHGEF6Q15052 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ARHGEF6Q15052 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ARHGEF6Q15052 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ARHGEF6Q15052 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ARHGEF6Q15052 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ARHGEF6Q15052 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ARHGEF6Q15052 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ARHGEF6Q15052 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ARHGEF6Q15052 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ARHGEF6Q15052 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ARHGEF6Q15052 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARHGEF6Q15052 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARHGEF6Q15052 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARHGEF6Q15052 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARHGEF6Q15052 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARHGEF6Q15052 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARHGEF6Q15052 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARHGEF6Q15052 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARHGEF6Q15052 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARHGEF6Q15052 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARHGEF6Q15052 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARHGEF6Q15052 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ARHGEF6Q15052 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARHGEF6Q15052 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ARHGEF6Q15052 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARHGEF6Q15052 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARHGEF6Q15052 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARHGEF6Q15052 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARHGEF6Q15052 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARHGEF6Q15052 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARHGEF6Q15052 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARHGEF6Q15052 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARHGEF6Q15052 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARHGEF6Q15052 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARHGEF6Q15052 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARHGEF6Q15052 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARHGEF6Q15052 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARHGEF6Q15052 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARHGEF6Q15052 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARHGEF6Q15052 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARHGEF6Q15052 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARHGEF6Q15052 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ARHGEF6Q15052 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARHGEF6Q15052 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARHGEF6Q15052 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARHGEF6Q15052 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARHGEF6Q15052 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARHGEF6Q15052 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARHGEF6Q15052 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARHGEF6Q15052 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARHGEF6Q15052 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARHGEF6Q15052 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARHGEF6Q15052 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARHGEF6Q15052 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARHGEF6Q15052 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARHGEF6Q15052 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARHGEF6Q15052 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARHGEF6Q15052 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARHGEF6Q15052 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARHGEF6Q15052 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARHGEF6Q15052 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARHGEF6Q15052 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARHGEF6Q15052 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARHGEF6Q15052 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARHGEF6Q15052 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARHGEF6Q15052 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARHGEF6Q15052 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARHGEF6Q15052 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARHGEF6Q15052 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARHGEF6Q15052 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARHGEF6Q15052 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARHGEF6Q15052 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARHGEF6Q15052 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ARHGEF6Q15052 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARHGEF6Q15052 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ARHGEF6Q15052 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARHGEF6Q15052 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ARHGEF6Q15052 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARHGEF6Q15052 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARHGEF6Q15052 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARHGEF6Q15052 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARHGEF6Q15052 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARHGEF6Q15052 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARHGEF6Q15052 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARHGEF6Q15052 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARHGEF6Q15052 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARHGEF6Q15052 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ARHGEF6Q15052 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARHGEF6Q15052 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARHGEF6Q15052 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARHGEF6Q15052 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARHGEF6Q15052 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARHGEF6Q15052 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARHGEF6Q15052 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ARHGEF6Q15052 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARHGEF6Q15052 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARHGEF6Q15052 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms