Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NCAPHQ15003 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NCAPHQ15003 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NCAPHQ15003 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NCAPHQ15003 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NCAPHQ15003 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NCAPHQ15003 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NCAPHQ15003 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NCAPHQ15003 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NCAPHQ15003 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
NCAPHQ15003 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NCAPHQ15003 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NCAPHQ15003 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NCAPHQ15003 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NCAPHQ15003 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
NCAPHQ15003 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NCAPHQ15003 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NCAPHQ15003 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NCAPHQ15003 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NCAPHQ15003 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NCAPHQ15003 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NCAPHQ15003 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NCAPHQ15003 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NCAPHQ15003 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NCAPHQ15003 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NCAPHQ15003 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NCAPHQ15003 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NCAPHQ15003 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NCAPHQ15003 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NCAPHQ15003 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NCAPHQ15003 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NCAPHQ15003 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NCAPHQ15003 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NCAPHQ15003 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
NCAPHQ15003 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
NCAPHQ15003 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
NCAPHQ15003 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NCAPHQ15003 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NCAPHQ15003 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NCAPHQ15003 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NCAPHQ15003 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NCAPHQ15003 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NCAPHQ15003 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NCAPHQ15003 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NCAPHQ15003 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NCAPHQ15003 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NCAPHQ15003 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NCAPHQ15003 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NCAPHQ15003 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NCAPHQ15003 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NCAPHQ15003 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NCAPHQ15003 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
NCAPHQ15003 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NCAPHQ15003 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NCAPHQ15003 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NCAPHQ15003 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NCAPHQ15003 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
NCAPHQ15003 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NCAPHQ15003 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
NCAPHQ15003 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NCAPHQ15003 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NCAPHQ15003 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NCAPHQ15003 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NCAPHQ15003 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NCAPHQ15003 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NCAPHQ15003 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NCAPHQ15003 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
NCAPHQ15003 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NCAPHQ15003 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NCAPHQ15003 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NCAPHQ15003 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NCAPHQ15003 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NCAPHQ15003 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NCAPHQ15003 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NCAPHQ15003 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NCAPHQ15003 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
NCAPHQ15003 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NCAPHQ15003 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NCAPHQ15003 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NCAPHQ15003 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NCAPHQ15003 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NCAPHQ15003 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NCAPHQ15003 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NCAPHQ15003 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NCAPHQ15003 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NCAPHQ15003 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NCAPHQ15003 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NCAPHQ15003 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NCAPHQ15003 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NCAPHQ15003 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NCAPHQ15003 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NCAPHQ15003 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NCAPHQ15003 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NCAPHQ15003 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NCAPHQ15003 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NCAPHQ15003 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NCAPHQ15003 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NCAPHQ15003 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
NCAPHQ15003 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
NCAPHQ15003 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms