Protein–RNA interactions for Protein: Q14997

PSME4, Proteasome activator complex subunit 4, humanhuman

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Length 1,843 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME4Q14997 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PSME4Q14997 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PSME4Q14997 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PSME4Q14997 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PSME4Q14997 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PSME4Q14997 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
PSME4Q14997 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PSME4Q14997 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PSME4Q14997 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PSME4Q14997 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
PSME4Q14997 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PSME4Q14997 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PSME4Q14997 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PSME4Q14997 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PSME4Q14997 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PSME4Q14997 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PSME4Q14997 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PSME4Q14997 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PSME4Q14997 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PSME4Q14997 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PSME4Q14997 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PSME4Q14997 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PSME4Q14997 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PSME4Q14997 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PSME4Q14997 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PSME4Q14997 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PSME4Q14997 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PSME4Q14997 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PSME4Q14997 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
PSME4Q14997 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PSME4Q14997 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PSME4Q14997 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PSME4Q14997 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PSME4Q14997 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PSME4Q14997 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PSME4Q14997 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PSME4Q14997 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PSME4Q14997 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PSME4Q14997 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PSME4Q14997 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PSME4Q14997 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PSME4Q14997 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PSME4Q14997 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PSME4Q14997 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PSME4Q14997 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PSME4Q14997 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PSME4Q14997 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PSME4Q14997 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
PSME4Q14997 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PSME4Q14997 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PSME4Q14997 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PSME4Q14997 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PSME4Q14997 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PSME4Q14997 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PSME4Q14997 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PSME4Q14997 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PSME4Q14997 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PSME4Q14997 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PSME4Q14997 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PSME4Q14997 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PSME4Q14997 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PSME4Q14997 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PSME4Q14997 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PSME4Q14997 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PSME4Q14997 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PSME4Q14997 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PSME4Q14997 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PSME4Q14997 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PSME4Q14997 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PSME4Q14997 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PSME4Q14997 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PSME4Q14997 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PSME4Q14997 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PSME4Q14997 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PSME4Q14997 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PSME4Q14997 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PSME4Q14997 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PSME4Q14997 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PSME4Q14997 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
PSME4Q14997 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PSME4Q14997 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
PSME4Q14997 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PSME4Q14997 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PSME4Q14997 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
PSME4Q14997 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PSME4Q14997 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PSME4Q14997 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
PSME4Q14997 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PSME4Q14997 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PSME4Q14997 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PSME4Q14997 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PSME4Q14997 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PSME4Q14997 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PSME4Q14997 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PSME4Q14997 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PSME4Q14997 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PSME4Q14997 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PSME4Q14997 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PSME4Q14997 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PSME4Q14997 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
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