Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NFIXQ14938 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NFIXQ14938 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NFIXQ14938 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NFIXQ14938 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NFIXQ14938 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NFIXQ14938 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NFIXQ14938 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NFIXQ14938 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NFIXQ14938 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NFIXQ14938 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NFIXQ14938 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NFIXQ14938 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NFIXQ14938 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NFIXQ14938 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NFIXQ14938 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NFIXQ14938 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NFIXQ14938 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NFIXQ14938 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NFIXQ14938 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NFIXQ14938 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NFIXQ14938 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NFIXQ14938 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NFIXQ14938 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NFIXQ14938 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NFIXQ14938 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NFIXQ14938 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NFIXQ14938 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NFIXQ14938 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NFIXQ14938 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NFIXQ14938 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NFIXQ14938 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NFIXQ14938 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NFIXQ14938 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NFIXQ14938 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NFIXQ14938 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NFIXQ14938 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NFIXQ14938 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NFIXQ14938 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NFIXQ14938 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NFIXQ14938 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NFIXQ14938 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NFIXQ14938 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NFIXQ14938 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NFIXQ14938 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NFIXQ14938 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NFIXQ14938 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NFIXQ14938 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NFIXQ14938 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NFIXQ14938 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NFIXQ14938 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NFIXQ14938 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NFIXQ14938 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NFIXQ14938 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NFIXQ14938 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NFIXQ14938 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NFIXQ14938 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NFIXQ14938 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NFIXQ14938 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NFIXQ14938 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NFIXQ14938 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NFIXQ14938 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NFIXQ14938 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NFIXQ14938 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NFIXQ14938 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NFIXQ14938 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NFIXQ14938 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NFIXQ14938 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NFIXQ14938 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NFIXQ14938 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NFIXQ14938 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NFIXQ14938 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NFIXQ14938 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NFIXQ14938 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NFIXQ14938 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NFIXQ14938 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NFIXQ14938 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NFIXQ14938 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NFIXQ14938 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NFIXQ14938 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NFIXQ14938 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NFIXQ14938 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NFIXQ14938 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NFIXQ14938 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NFIXQ14938 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NFIXQ14938 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NFIXQ14938 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NFIXQ14938 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NFIXQ14938 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NFIXQ14938 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NFIXQ14938 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NFIXQ14938 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NFIXQ14938 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NFIXQ14938 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NFIXQ14938 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NFIXQ14938 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NFIXQ14938 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NFIXQ14938 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NFIXQ14938 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NFIXQ14938 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
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