Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SCARF1Q14162 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCARF1Q14162 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SCARF1Q14162 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCARF1Q14162 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SCARF1Q14162 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCARF1Q14162 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCARF1Q14162 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCARF1Q14162 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCARF1Q14162 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCARF1Q14162 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCARF1Q14162 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCARF1Q14162 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCARF1Q14162 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCARF1Q14162 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCARF1Q14162 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCARF1Q14162 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCARF1Q14162 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCARF1Q14162 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCARF1Q14162 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCARF1Q14162 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCARF1Q14162 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCARF1Q14162 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SCARF1Q14162 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCARF1Q14162 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCARF1Q14162 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCARF1Q14162 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SCARF1Q14162 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCARF1Q14162 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCARF1Q14162 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCARF1Q14162 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SCARF1Q14162 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCARF1Q14162 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCARF1Q14162 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCARF1Q14162 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCARF1Q14162 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SCARF1Q14162 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCARF1Q14162 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCARF1Q14162 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCARF1Q14162 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCARF1Q14162 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCARF1Q14162 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCARF1Q14162 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCARF1Q14162 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCARF1Q14162 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCARF1Q14162 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCARF1Q14162 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCARF1Q14162 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCARF1Q14162 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCARF1Q14162 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCARF1Q14162 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCARF1Q14162 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCARF1Q14162 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SCARF1Q14162 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCARF1Q14162 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCARF1Q14162 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCARF1Q14162 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCARF1Q14162 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCARF1Q14162 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCARF1Q14162 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCARF1Q14162 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCARF1Q14162 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCARF1Q14162 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCARF1Q14162 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCARF1Q14162 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCARF1Q14162 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCARF1Q14162 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCARF1Q14162 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCARF1Q14162 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCARF1Q14162 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCARF1Q14162 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCARF1Q14162 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCARF1Q14162 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCARF1Q14162 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SCARF1Q14162 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCARF1Q14162 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SCARF1Q14162 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCARF1Q14162 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCARF1Q14162 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCARF1Q14162 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCARF1Q14162 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCARF1Q14162 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCARF1Q14162 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCARF1Q14162 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCARF1Q14162 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCARF1Q14162 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCARF1Q14162 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SCARF1Q14162 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCARF1Q14162 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SCARF1Q14162 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SCARF1Q14162 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SCARF1Q14162 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SCARF1Q14162 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SCARF1Q14162 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SCARF1Q14162 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCARF1Q14162 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCARF1Q14162 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCARF1Q14162 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCARF1Q14162 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCARF1Q14162 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
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