Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
COL4A6Q14031 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
COL4A6Q14031 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
COL4A6Q14031 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
COL4A6Q14031 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
COL4A6Q14031 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
COL4A6Q14031 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
COL4A6Q14031 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
COL4A6Q14031 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
COL4A6Q14031 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
COL4A6Q14031 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
COL4A6Q14031 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
COL4A6Q14031 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
COL4A6Q14031 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
COL4A6Q14031 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
COL4A6Q14031 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
COL4A6Q14031 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
COL4A6Q14031 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
COL4A6Q14031 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
COL4A6Q14031 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
COL4A6Q14031 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
COL4A6Q14031 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
COL4A6Q14031 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
COL4A6Q14031 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
COL4A6Q14031 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
COL4A6Q14031 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
COL4A6Q14031 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
COL4A6Q14031 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
COL4A6Q14031 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
COL4A6Q14031 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
COL4A6Q14031 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
COL4A6Q14031 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
COL4A6Q14031 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
COL4A6Q14031 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
COL4A6Q14031 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
COL4A6Q14031 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
COL4A6Q14031 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
COL4A6Q14031 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
COL4A6Q14031 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
COL4A6Q14031 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
COL4A6Q14031 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
COL4A6Q14031 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
COL4A6Q14031 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
COL4A6Q14031 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
COL4A6Q14031 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
COL4A6Q14031 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
COL4A6Q14031 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
COL4A6Q14031 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
COL4A6Q14031 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
COL4A6Q14031 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
COL4A6Q14031 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
COL4A6Q14031 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
COL4A6Q14031 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
COL4A6Q14031 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
COL4A6Q14031 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
COL4A6Q14031 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
COL4A6Q14031 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
COL4A6Q14031 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
COL4A6Q14031 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
COL4A6Q14031 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
COL4A6Q14031 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
COL4A6Q14031 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
COL4A6Q14031 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
COL4A6Q14031 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
COL4A6Q14031 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
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COL4A6Q14031 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
COL4A6Q14031 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
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COL4A6Q14031 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
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COL4A6Q14031 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
COL4A6Q14031 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
COL4A6Q14031 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
COL4A6Q14031 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
COL4A6Q14031 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
COL4A6Q14031 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
COL4A6Q14031 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
COL4A6Q14031 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
COL4A6Q14031 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
COL4A6Q14031 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
COL4A6Q14031 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
COL4A6Q14031 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
COL4A6Q14031 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COL4A6Q14031 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
COL4A6Q14031 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
COL4A6Q14031 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COL4A6Q14031 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
COL4A6Q14031 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COL4A6Q14031 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
COL4A6Q14031 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
COL4A6Q14031 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
COL4A6Q14031 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COL4A6Q14031 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COL4A6Q14031 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms