Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCINQ13939 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCINQ13939 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CCINQ13939 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCINQ13939 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCINQ13939 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCINQ13939 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCINQ13939 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CCINQ13939 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCINQ13939 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCINQ13939 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCINQ13939 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCINQ13939 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCINQ13939 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCINQ13939 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCINQ13939 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCINQ13939 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCINQ13939 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCINQ13939 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCINQ13939 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCINQ13939 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCINQ13939 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCINQ13939 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCINQ13939 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCINQ13939 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCINQ13939 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCINQ13939 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCINQ13939 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCINQ13939 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CCINQ13939 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCINQ13939 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCINQ13939 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCINQ13939 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCINQ13939 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCINQ13939 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCINQ13939 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCINQ13939 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCINQ13939 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CCINQ13939 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCINQ13939 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CCINQ13939 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCINQ13939 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCINQ13939 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCINQ13939 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCINQ13939 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCINQ13939 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCINQ13939 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCINQ13939 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCINQ13939 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCINQ13939 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCINQ13939 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCINQ13939 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCINQ13939 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
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CCINQ13939 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCINQ13939 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
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CCINQ13939 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
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CCINQ13939 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCINQ13939 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
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CCINQ13939 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
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CCINQ13939 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
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CCINQ13939 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
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CCINQ13939 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCINQ13939 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCINQ13939 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
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CCINQ13939 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCINQ13939 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCINQ13939 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCINQ13939 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCINQ13939 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCINQ13939 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCINQ13939 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCINQ13939 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCINQ13939 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCINQ13939 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCINQ13939 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CCINQ13939 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCINQ13939 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCINQ13939 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCINQ13939 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCINQ13939 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCINQ13939 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCINQ13939 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCINQ13939 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCINQ13939 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCINQ13939 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
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