Protein–RNA interactions for Protein: Q13888

GTF2H2, General transcription factor IIH subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H2Q13888 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2H2Q13888 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms