Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RUNX3Q13761 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RUNX3Q13761 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RUNX3Q13761 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RUNX3Q13761 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RUNX3Q13761 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RUNX3Q13761 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RUNX3Q13761 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RUNX3Q13761 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RUNX3Q13761 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RUNX3Q13761 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RUNX3Q13761 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RUNX3Q13761 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RUNX3Q13761 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RUNX3Q13761 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RUNX3Q13761 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RUNX3Q13761 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RUNX3Q13761 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RUNX3Q13761 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RUNX3Q13761 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RUNX3Q13761 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RUNX3Q13761 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RUNX3Q13761 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RUNX3Q13761 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RUNX3Q13761 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RUNX3Q13761 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RUNX3Q13761 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RUNX3Q13761 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RUNX3Q13761 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RUNX3Q13761 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RUNX3Q13761 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RUNX3Q13761 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RUNX3Q13761 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RUNX3Q13761 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RUNX3Q13761 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RUNX3Q13761 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RUNX3Q13761 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RUNX3Q13761 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RUNX3Q13761 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RUNX3Q13761 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RUNX3Q13761 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RUNX3Q13761 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RUNX3Q13761 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RUNX3Q13761 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RUNX3Q13761 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RUNX3Q13761 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RUNX3Q13761 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RUNX3Q13761 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RUNX3Q13761 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RUNX3Q13761 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RUNX3Q13761 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RUNX3Q13761 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RUNX3Q13761 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RUNX3Q13761 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RUNX3Q13761 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RUNX3Q13761 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RUNX3Q13761 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RUNX3Q13761 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RUNX3Q13761 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RUNX3Q13761 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RUNX3Q13761 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RUNX3Q13761 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RUNX3Q13761 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RUNX3Q13761 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RUNX3Q13761 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RUNX3Q13761 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RUNX3Q13761 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RUNX3Q13761 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RUNX3Q13761 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RUNX3Q13761 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RUNX3Q13761 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RUNX3Q13761 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RUNX3Q13761 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RUNX3Q13761 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RUNX3Q13761 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RUNX3Q13761 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RUNX3Q13761 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RUNX3Q13761 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RUNX3Q13761 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RUNX3Q13761 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RUNX3Q13761 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RUNX3Q13761 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RUNX3Q13761 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RUNX3Q13761 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
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