Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CDH18Q13634 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDH18Q13634 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDH18Q13634 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CDH18Q13634 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDH18Q13634 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDH18Q13634 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDH18Q13634 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDH18Q13634 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDH18Q13634 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDH18Q13634 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDH18Q13634 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDH18Q13634 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CDH18Q13634 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDH18Q13634 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDH18Q13634 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDH18Q13634 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDH18Q13634 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDH18Q13634 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDH18Q13634 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDH18Q13634 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDH18Q13634 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDH18Q13634 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CDH18Q13634 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDH18Q13634 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDH18Q13634 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CDH18Q13634 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDH18Q13634 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDH18Q13634 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDH18Q13634 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CDH18Q13634 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDH18Q13634 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDH18Q13634 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CDH18Q13634 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDH18Q13634 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDH18Q13634 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDH18Q13634 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDH18Q13634 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDH18Q13634 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDH18Q13634 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDH18Q13634 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDH18Q13634 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDH18Q13634 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDH18Q13634 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDH18Q13634 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDH18Q13634 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDH18Q13634 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CDH18Q13634 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDH18Q13634 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDH18Q13634 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDH18Q13634 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDH18Q13634 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDH18Q13634 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDH18Q13634 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDH18Q13634 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDH18Q13634 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDH18Q13634 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
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CDH18Q13634 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDH18Q13634 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CDH18Q13634 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDH18Q13634 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDH18Q13634 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CDH18Q13634 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CDH18Q13634 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDH18Q13634 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDH18Q13634 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDH18Q13634 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDH18Q13634 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDH18Q13634 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDH18Q13634 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDH18Q13634 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CDH18Q13634 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDH18Q13634 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDH18Q13634 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDH18Q13634 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDH18Q13634 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CDH18Q13634 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDH18Q13634 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDH18Q13634 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDH18Q13634 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDH18Q13634 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDH18Q13634 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDH18Q13634 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDH18Q13634 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CDH18Q13634 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDH18Q13634 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CDH18Q13634 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDH18Q13634 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDH18Q13634 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDH18Q13634 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDH18Q13634 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDH18Q13634 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDH18Q13634 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDH18Q13634 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDH18Q13634 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDH18Q13634 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDH18Q13634 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDH18Q13634 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDH18Q13634 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
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