Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

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Length 980 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PEX6Q13608 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PEX6Q13608 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PEX6Q13608 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PEX6Q13608 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PEX6Q13608 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PEX6Q13608 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PEX6Q13608 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PEX6Q13608 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PEX6Q13608 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PEX6Q13608 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PEX6Q13608 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PEX6Q13608 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PEX6Q13608 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PEX6Q13608 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PEX6Q13608 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PEX6Q13608 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PEX6Q13608 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PEX6Q13608 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PEX6Q13608 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PEX6Q13608 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PEX6Q13608 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PEX6Q13608 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PEX6Q13608 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PEX6Q13608 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PEX6Q13608 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
PEX6Q13608 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PEX6Q13608 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PEX6Q13608 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PEX6Q13608 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PEX6Q13608 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PEX6Q13608 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PEX6Q13608 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PEX6Q13608 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PEX6Q13608 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PEX6Q13608 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PEX6Q13608 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PEX6Q13608 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PEX6Q13608 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PEX6Q13608 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PEX6Q13608 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PEX6Q13608 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
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PEX6Q13608 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PEX6Q13608 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PEX6Q13608 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PEX6Q13608 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PEX6Q13608 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PEX6Q13608 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PEX6Q13608 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PEX6Q13608 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PEX6Q13608 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PEX6Q13608 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
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PEX6Q13608 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PEX6Q13608 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PEX6Q13608 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PEX6Q13608 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PEX6Q13608 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
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PEX6Q13608 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
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PEX6Q13608 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PEX6Q13608 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PEX6Q13608 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PEX6Q13608 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
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PEX6Q13608 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PEX6Q13608 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PEX6Q13608 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PEX6Q13608 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PEX6Q13608 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PEX6Q13608 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PEX6Q13608 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PEX6Q13608 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PEX6Q13608 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PEX6Q13608 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PEX6Q13608 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PEX6Q13608 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PEX6Q13608 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PEX6Q13608 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PEX6Q13608 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PEX6Q13608 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PEX6Q13608 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PEX6Q13608 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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