Protein–RNA interactions for Protein: Q13492

PICALM, Phosphatidylinositol-binding clathrin assembly protein, humanhuman

Predictions only

Length 652 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PICALMQ13492 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PICALMQ13492 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PICALMQ13492 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PICALMQ13492 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PICALMQ13492 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PICALMQ13492 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PICALMQ13492 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PICALMQ13492 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PICALMQ13492 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PICALMQ13492 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PICALMQ13492 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PICALMQ13492 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PICALMQ13492 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PICALMQ13492 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PICALMQ13492 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PICALMQ13492 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PICALMQ13492 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PICALMQ13492 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PICALMQ13492 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PICALMQ13492 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PICALMQ13492 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PICALMQ13492 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PICALMQ13492 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PICALMQ13492 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PICALMQ13492 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PICALMQ13492 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PICALMQ13492 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PICALMQ13492 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PICALMQ13492 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PICALMQ13492 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PICALMQ13492 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PICALMQ13492 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PICALMQ13492 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PICALMQ13492 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PICALMQ13492 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PICALMQ13492 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PICALMQ13492 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PICALMQ13492 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PICALMQ13492 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PICALMQ13492 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PICALMQ13492 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PICALMQ13492 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PICALMQ13492 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PICALMQ13492 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PICALMQ13492 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PICALMQ13492 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PICALMQ13492 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PICALMQ13492 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PICALMQ13492 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PICALMQ13492 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PICALMQ13492 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PICALMQ13492 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PICALMQ13492 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PICALMQ13492 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PICALMQ13492 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PICALMQ13492 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PICALMQ13492 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PICALMQ13492 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PICALMQ13492 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PICALMQ13492 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PICALMQ13492 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PICALMQ13492 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PICALMQ13492 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PICALMQ13492 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PICALMQ13492 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PICALMQ13492 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PICALMQ13492 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PICALMQ13492 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PICALMQ13492 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PICALMQ13492 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PICALMQ13492 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PICALMQ13492 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PICALMQ13492 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PICALMQ13492 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PICALMQ13492 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PICALMQ13492 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PICALMQ13492 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PICALMQ13492 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
PICALMQ13492 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PICALMQ13492 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PICALMQ13492 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PICALMQ13492 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
PICALMQ13492 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PICALMQ13492 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PICALMQ13492 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PICALMQ13492 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
PICALMQ13492 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PICALMQ13492 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PICALMQ13492 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
PICALMQ13492 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PICALMQ13492 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PICALMQ13492 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PICALMQ13492 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PICALMQ13492 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PICALMQ13492 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PICALMQ13492 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PICALMQ13492 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PICALMQ13492 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
PICALMQ13492 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PICALMQ13492 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
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