Protein–RNA interactions for Protein: Q13491

GPM6B, Neuronal membrane glycoprotein M6-b, humanhuman

Predictions only

Length 265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPM6BQ13491 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GPM6BQ13491 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GPM6BQ13491 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GPM6BQ13491 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GPM6BQ13491 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GPM6BQ13491 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GPM6BQ13491 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GPM6BQ13491 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
GPM6BQ13491 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
GPM6BQ13491 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
GPM6BQ13491 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GPM6BQ13491 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GPM6BQ13491 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GPM6BQ13491 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GPM6BQ13491 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GPM6BQ13491 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
GPM6BQ13491 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GPM6BQ13491 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GPM6BQ13491 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GPM6BQ13491 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GPM6BQ13491 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GPM6BQ13491 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GPM6BQ13491 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GPM6BQ13491 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GPM6BQ13491 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GPM6BQ13491 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GPM6BQ13491 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GPM6BQ13491 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GPM6BQ13491 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GPM6BQ13491 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GPM6BQ13491 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GPM6BQ13491 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GPM6BQ13491 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GPM6BQ13491 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GPM6BQ13491 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GPM6BQ13491 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GPM6BQ13491 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GPM6BQ13491 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GPM6BQ13491 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GPM6BQ13491 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
GPM6BQ13491 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GPM6BQ13491 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GPM6BQ13491 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GPM6BQ13491 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
GPM6BQ13491 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GPM6BQ13491 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GPM6BQ13491 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GPM6BQ13491 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GPM6BQ13491 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
GPM6BQ13491 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GPM6BQ13491 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GPM6BQ13491 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
GPM6BQ13491 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
GPM6BQ13491 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GPM6BQ13491 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GPM6BQ13491 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GPM6BQ13491 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GPM6BQ13491 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GPM6BQ13491 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GPM6BQ13491 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GPM6BQ13491 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GPM6BQ13491 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GPM6BQ13491 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GPM6BQ13491 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
GPM6BQ13491 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GPM6BQ13491 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GPM6BQ13491 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
GPM6BQ13491 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GPM6BQ13491 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
GPM6BQ13491 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GPM6BQ13491 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GPM6BQ13491 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GPM6BQ13491 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GPM6BQ13491 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GPM6BQ13491 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GPM6BQ13491 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GPM6BQ13491 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GPM6BQ13491 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GPM6BQ13491 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GPM6BQ13491 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GPM6BQ13491 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GPM6BQ13491 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GPM6BQ13491 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GPM6BQ13491 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GPM6BQ13491 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GPM6BQ13491 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
GPM6BQ13491 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GPM6BQ13491 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GPM6BQ13491 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GPM6BQ13491 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GPM6BQ13491 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GPM6BQ13491 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GPM6BQ13491 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GPM6BQ13491 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GPM6BQ13491 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GPM6BQ13491 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GPM6BQ13491 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GPM6BQ13491 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GPM6BQ13491 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GPM6BQ13491 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
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