Protein–RNA interactions for Protein: Q13439

GOLGA4, Golgin subfamily A member 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA4Q13439 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GOLGA4Q13439 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms