Protein–RNA interactions for Protein: Q13425

SNTB2, Beta-2-syntrophin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTB2Q13425 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNTB2Q13425 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SNTB2Q13425 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNTB2Q13425 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNTB2Q13425 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNTB2Q13425 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNTB2Q13425 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SNTB2Q13425 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SNTB2Q13425 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNTB2Q13425 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNTB2Q13425 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNTB2Q13425 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNTB2Q13425 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNTB2Q13425 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNTB2Q13425 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNTB2Q13425 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNTB2Q13425 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNTB2Q13425 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNTB2Q13425 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNTB2Q13425 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNTB2Q13425 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNTB2Q13425 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNTB2Q13425 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNTB2Q13425 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNTB2Q13425 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNTB2Q13425 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNTB2Q13425 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNTB2Q13425 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNTB2Q13425 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNTB2Q13425 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SNTB2Q13425 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNTB2Q13425 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNTB2Q13425 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNTB2Q13425 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNTB2Q13425 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNTB2Q13425 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SNTB2Q13425 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNTB2Q13425 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SNTB2Q13425 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNTB2Q13425 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNTB2Q13425 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SNTB2Q13425 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNTB2Q13425 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNTB2Q13425 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNTB2Q13425 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SNTB2Q13425 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SNTB2Q13425 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNTB2Q13425 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNTB2Q13425 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNTB2Q13425 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNTB2Q13425 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNTB2Q13425 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNTB2Q13425 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNTB2Q13425 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNTB2Q13425 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNTB2Q13425 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNTB2Q13425 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNTB2Q13425 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNTB2Q13425 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNTB2Q13425 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNTB2Q13425 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNTB2Q13425 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNTB2Q13425 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNTB2Q13425 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNTB2Q13425 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNTB2Q13425 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNTB2Q13425 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNTB2Q13425 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNTB2Q13425 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNTB2Q13425 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNTB2Q13425 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNTB2Q13425 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNTB2Q13425 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNTB2Q13425 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNTB2Q13425 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNTB2Q13425 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNTB2Q13425 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNTB2Q13425 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNTB2Q13425 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNTB2Q13425 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNTB2Q13425 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNTB2Q13425 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SNTB2Q13425 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNTB2Q13425 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SNTB2Q13425 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SNTB2Q13425 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNTB2Q13425 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNTB2Q13425 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SNTB2Q13425 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNTB2Q13425 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNTB2Q13425 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNTB2Q13425 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNTB2Q13425 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNTB2Q13425 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNTB2Q13425 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNTB2Q13425 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNTB2Q13425 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNTB2Q13425 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNTB2Q13425 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNTB2Q13425 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
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