Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
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SGCGQ13326 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
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SGCGQ13326 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SGCGQ13326 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SGCGQ13326 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SGCGQ13326 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SGCGQ13326 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SGCGQ13326 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SGCGQ13326 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
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SGCGQ13326 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
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SGCGQ13326 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SGCGQ13326 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SGCGQ13326 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SGCGQ13326 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SGCGQ13326 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SGCGQ13326 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
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SGCGQ13326 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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SGCGQ13326 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SGCGQ13326 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SGCGQ13326 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SGCGQ13326 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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SGCGQ13326 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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SGCGQ13326 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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SGCGQ13326 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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SGCGQ13326 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SGCGQ13326 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SGCGQ13326 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SGCGQ13326 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SGCGQ13326 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SGCGQ13326 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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SGCGQ13326 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SGCGQ13326 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SGCGQ13326 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SGCGQ13326 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SGCGQ13326 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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SGCGQ13326 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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SGCGQ13326 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SGCGQ13326 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SGCGQ13326 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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SGCGQ13326 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SGCGQ13326 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGCGQ13326 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGCGQ13326 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGCGQ13326 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SGCGQ13326 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGCGQ13326 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGCGQ13326 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGCGQ13326 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGCGQ13326 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SGCGQ13326 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGCGQ13326 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGCGQ13326 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGCGQ13326 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGCGQ13326 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
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