Protein–RNA interactions for Protein: Q13319

CDK5R2, Cyclin-dependent kinase 5 activator 2, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5R2Q13319 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDK5R2Q13319 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDK5R2Q13319 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDK5R2Q13319 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CDK5R2Q13319 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDK5R2Q13319 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDK5R2Q13319 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDK5R2Q13319 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDK5R2Q13319 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDK5R2Q13319 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDK5R2Q13319 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDK5R2Q13319 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDK5R2Q13319 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDK5R2Q13319 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDK5R2Q13319 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDK5R2Q13319 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDK5R2Q13319 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDK5R2Q13319 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDK5R2Q13319 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDK5R2Q13319 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDK5R2Q13319 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDK5R2Q13319 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDK5R2Q13319 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDK5R2Q13319 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDK5R2Q13319 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDK5R2Q13319 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDK5R2Q13319 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDK5R2Q13319 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDK5R2Q13319 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDK5R2Q13319 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDK5R2Q13319 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDK5R2Q13319 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDK5R2Q13319 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDK5R2Q13319 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDK5R2Q13319 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDK5R2Q13319 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CDK5R2Q13319 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CDK5R2Q13319 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CDK5R2Q13319 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDK5R2Q13319 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDK5R2Q13319 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CDK5R2Q13319 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDK5R2Q13319 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDK5R2Q13319 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDK5R2Q13319 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDK5R2Q13319 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDK5R2Q13319 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDK5R2Q13319 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDK5R2Q13319 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDK5R2Q13319 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDK5R2Q13319 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDK5R2Q13319 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDK5R2Q13319 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDK5R2Q13319 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDK5R2Q13319 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK5R2Q13319 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK5R2Q13319 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK5R2Q13319 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK5R2Q13319 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK5R2Q13319 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK5R2Q13319 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK5R2Q13319 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK5R2Q13319 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK5R2Q13319 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK5R2Q13319 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK5R2Q13319 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK5R2Q13319 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK5R2Q13319 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK5R2Q13319 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK5R2Q13319 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK5R2Q13319 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK5R2Q13319 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK5R2Q13319 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK5R2Q13319 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK5R2Q13319 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK5R2Q13319 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK5R2Q13319 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK5R2Q13319 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK5R2Q13319 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK5R2Q13319 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK5R2Q13319 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK5R2Q13319 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK5R2Q13319 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CDK5R2Q13319 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CDK5R2Q13319 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CDK5R2Q13319 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CDK5R2Q13319 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CDK5R2Q13319 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms