Protein–RNA interactions for Protein: Q13278

RIG, Putative protein RIG, humanhuman

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIGQ13278 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
RIGQ13278 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RIGQ13278 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RIGQ13278 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
RIGQ13278 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RIGQ13278 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RIGQ13278 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RIGQ13278 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RIGQ13278 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RIGQ13278 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RIGQ13278 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RIGQ13278 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RIGQ13278 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RIGQ13278 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RIGQ13278 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RIGQ13278 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RIGQ13278 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RIGQ13278 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RIGQ13278 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RIGQ13278 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RIGQ13278 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RIGQ13278 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RIGQ13278 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RIGQ13278 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RIGQ13278 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RIGQ13278 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RIGQ13278 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RIGQ13278 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RIGQ13278 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RIGQ13278 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RIGQ13278 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RIGQ13278 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RIGQ13278 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RIGQ13278 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RIGQ13278 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RIGQ13278 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RIGQ13278 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RIGQ13278 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RIGQ13278 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RIGQ13278 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RIGQ13278 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RIGQ13278 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RIGQ13278 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RIGQ13278 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RIGQ13278 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
RIGQ13278 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
RIGQ13278 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
RIGQ13278 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RIGQ13278 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RIGQ13278 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RIGQ13278 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RIGQ13278 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RIGQ13278 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RIGQ13278 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RIGQ13278 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RIGQ13278 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RIGQ13278 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RIGQ13278 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
RIGQ13278 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
RIGQ13278 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
RIGQ13278 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
RIGQ13278 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
RIGQ13278 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
RIGQ13278 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
RIGQ13278 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
RIGQ13278 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
RIGQ13278 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
RIGQ13278 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RIGQ13278 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RIGQ13278 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RIGQ13278 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RIGQ13278 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RIGQ13278 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RIGQ13278 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RIGQ13278 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RIGQ13278 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RIGQ13278 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RIGQ13278 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RIGQ13278 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RIGQ13278 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RIGQ13278 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RIGQ13278 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RIGQ13278 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RIGQ13278 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RIGQ13278 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RIGQ13278 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RIGQ13278 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RIGQ13278 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RIGQ13278 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RIGQ13278 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RIGQ13278 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RIGQ13278 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RIGQ13278 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RIGQ13278 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RIGQ13278 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RIGQ13278 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RIGQ13278 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RIGQ13278 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RIGQ13278 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RIGQ13278 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
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