Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTGDRQ13258 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTGDRQ13258 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTGDRQ13258 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTGDRQ13258 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTGDRQ13258 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTGDRQ13258 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTGDRQ13258 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PTGDRQ13258 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTGDRQ13258 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTGDRQ13258 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTGDRQ13258 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTGDRQ13258 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTGDRQ13258 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTGDRQ13258 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTGDRQ13258 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTGDRQ13258 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTGDRQ13258 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTGDRQ13258 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTGDRQ13258 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTGDRQ13258 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTGDRQ13258 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTGDRQ13258 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTGDRQ13258 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTGDRQ13258 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTGDRQ13258 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTGDRQ13258 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTGDRQ13258 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTGDRQ13258 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTGDRQ13258 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTGDRQ13258 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PTGDRQ13258 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTGDRQ13258 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PTGDRQ13258 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTGDRQ13258 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTGDRQ13258 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PTGDRQ13258 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTGDRQ13258 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTGDRQ13258 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTGDRQ13258 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTGDRQ13258 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTGDRQ13258 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTGDRQ13258 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTGDRQ13258 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTGDRQ13258 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTGDRQ13258 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTGDRQ13258 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTGDRQ13258 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTGDRQ13258 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTGDRQ13258 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTGDRQ13258 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTGDRQ13258 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PTGDRQ13258 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTGDRQ13258 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTGDRQ13258 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTGDRQ13258 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTGDRQ13258 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTGDRQ13258 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PTGDRQ13258 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTGDRQ13258 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTGDRQ13258 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTGDRQ13258 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTGDRQ13258 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTGDRQ13258 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTGDRQ13258 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTGDRQ13258 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTGDRQ13258 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTGDRQ13258 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTGDRQ13258 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTGDRQ13258 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTGDRQ13258 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTGDRQ13258 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTGDRQ13258 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTGDRQ13258 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms