Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAF3Q13114 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAF3Q13114 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAF3Q13114 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAF3Q13114 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAF3Q13114 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAF3Q13114 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAF3Q13114 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAF3Q13114 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAF3Q13114 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAF3Q13114 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAF3Q13114 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAF3Q13114 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAF3Q13114 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAF3Q13114 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAF3Q13114 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAF3Q13114 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAF3Q13114 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAF3Q13114 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAF3Q13114 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAF3Q13114 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAF3Q13114 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAF3Q13114 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAF3Q13114 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
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TRAF3Q13114 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAF3Q13114 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAF3Q13114 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAF3Q13114 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAF3Q13114 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAF3Q13114 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAF3Q13114 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAF3Q13114 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAF3Q13114 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAF3Q13114 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAF3Q13114 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAF3Q13114 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAF3Q13114 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
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TRAF3Q13114 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAF3Q13114 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
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TRAF3Q13114 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
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TRAF3Q13114 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
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TRAF3Q13114 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
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TRAF3Q13114 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
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TRAF3Q13114 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAF3Q13114 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAF3Q13114 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAF3Q13114 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAF3Q13114 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAF3Q13114 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAF3Q13114 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAF3Q13114 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAF3Q13114 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAF3Q13114 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAF3Q13114 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
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