Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHAF1AQ13111 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHAF1AQ13111 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHAF1AQ13111 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHAF1AQ13111 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHAF1AQ13111 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHAF1AQ13111 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHAF1AQ13111 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHAF1AQ13111 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHAF1AQ13111 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHAF1AQ13111 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHAF1AQ13111 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHAF1AQ13111 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHAF1AQ13111 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHAF1AQ13111 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHAF1AQ13111 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHAF1AQ13111 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHAF1AQ13111 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHAF1AQ13111 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHAF1AQ13111 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHAF1AQ13111 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHAF1AQ13111 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHAF1AQ13111 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHAF1AQ13111 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHAF1AQ13111 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHAF1AQ13111 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHAF1AQ13111 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHAF1AQ13111 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHAF1AQ13111 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHAF1AQ13111 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CHAF1AQ13111 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHAF1AQ13111 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHAF1AQ13111 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CHAF1AQ13111 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CHAF1AQ13111 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHAF1AQ13111 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHAF1AQ13111 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHAF1AQ13111 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHAF1AQ13111 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHAF1AQ13111 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHAF1AQ13111 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHAF1AQ13111 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHAF1AQ13111 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHAF1AQ13111 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHAF1AQ13111 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHAF1AQ13111 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHAF1AQ13111 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHAF1AQ13111 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHAF1AQ13111 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHAF1AQ13111 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHAF1AQ13111 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHAF1AQ13111 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHAF1AQ13111 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHAF1AQ13111 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHAF1AQ13111 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHAF1AQ13111 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHAF1AQ13111 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHAF1AQ13111 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHAF1AQ13111 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHAF1AQ13111 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHAF1AQ13111 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHAF1AQ13111 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHAF1AQ13111 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CHAF1AQ13111 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHAF1AQ13111 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHAF1AQ13111 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHAF1AQ13111 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHAF1AQ13111 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHAF1AQ13111 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHAF1AQ13111 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHAF1AQ13111 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CHAF1AQ13111 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CHAF1AQ13111 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHAF1AQ13111 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHAF1AQ13111 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHAF1AQ13111 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHAF1AQ13111 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHAF1AQ13111 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHAF1AQ13111 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHAF1AQ13111 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHAF1AQ13111 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHAF1AQ13111 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHAF1AQ13111 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHAF1AQ13111 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHAF1AQ13111 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHAF1AQ13111 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHAF1AQ13111 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHAF1AQ13111 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHAF1AQ13111 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHAF1AQ13111 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHAF1AQ13111 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHAF1AQ13111 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHAF1AQ13111 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHAF1AQ13111 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHAF1AQ13111 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHAF1AQ13111 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHAF1AQ13111 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHAF1AQ13111 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHAF1AQ13111 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHAF1AQ13111 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms