Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
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IFT88Q13099 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
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