Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

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Length 1,464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
GRIN2AQ12879 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
GRIN2AQ12879 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
GRIN2AQ12879 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
GRIN2AQ12879 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
GRIN2AQ12879 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
GRIN2AQ12879 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
GRIN2AQ12879 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
GRIN2AQ12879 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
GRIN2AQ12879 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC28.85■■■□□ 2.21
GRIN2AQ12879 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
GRIN2AQ12879 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
GRIN2AQ12879 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
GRIN2AQ12879 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
GRIN2AQ12879 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
GRIN2AQ12879 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
GRIN2AQ12879 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
GRIN2AQ12879 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
GRIN2AQ12879 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
GRIN2AQ12879 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
GRIN2AQ12879 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
GRIN2AQ12879 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
GRIN2AQ12879 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
GRIN2AQ12879 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
GRIN2AQ12879 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
GRIN2AQ12879 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
GRIN2AQ12879 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
GRIN2AQ12879 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
GRIN2AQ12879 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
GRIN2AQ12879 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
GRIN2AQ12879 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
GRIN2AQ12879 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
GRIN2AQ12879 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
GRIN2AQ12879 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
GRIN2AQ12879 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
GRIN2AQ12879 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
GRIN2AQ12879 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
GRIN2AQ12879 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
GRIN2AQ12879 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
GRIN2AQ12879 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
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GRIN2AQ12879 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
GRIN2AQ12879 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
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GRIN2AQ12879 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
GRIN2AQ12879 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
GRIN2AQ12879 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
GRIN2AQ12879 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
GRIN2AQ12879 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
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GRIN2AQ12879 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
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GRIN2AQ12879 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
GRIN2AQ12879 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
GRIN2AQ12879 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
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GRIN2AQ12879 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
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GRIN2AQ12879 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
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GRIN2AQ12879 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
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GRIN2AQ12879 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
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GRIN2AQ12879 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
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GRIN2AQ12879 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
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GRIN2AQ12879 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
GRIN2AQ12879 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
GRIN2AQ12879 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
GRIN2AQ12879 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
GRIN2AQ12879 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
GRIN2AQ12879 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
GRIN2AQ12879 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
GRIN2AQ12879 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
GRIN2AQ12879 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
GRIN2AQ12879 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
GRIN2AQ12879 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
GRIN2AQ12879 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
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