Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NFIAQ12857 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NFIAQ12857 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NFIAQ12857 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NFIAQ12857 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NFIAQ12857 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NFIAQ12857 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NFIAQ12857 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NFIAQ12857 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NFIAQ12857 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NFIAQ12857 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
NFIAQ12857 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NFIAQ12857 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NFIAQ12857 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NFIAQ12857 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NFIAQ12857 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NFIAQ12857 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
NFIAQ12857 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NFIAQ12857 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NFIAQ12857 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NFIAQ12857 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NFIAQ12857 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NFIAQ12857 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NFIAQ12857 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NFIAQ12857 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NFIAQ12857 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NFIAQ12857 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NFIAQ12857 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NFIAQ12857 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NFIAQ12857 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
NFIAQ12857 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NFIAQ12857 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NFIAQ12857 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NFIAQ12857 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
NFIAQ12857 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
NFIAQ12857 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NFIAQ12857 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
NFIAQ12857 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NFIAQ12857 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NFIAQ12857 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
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NFIAQ12857 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
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NFIAQ12857 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NFIAQ12857 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NFIAQ12857 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
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NFIAQ12857 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NFIAQ12857 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
NFIAQ12857 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
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NFIAQ12857 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NFIAQ12857 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NFIAQ12857 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NFIAQ12857 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NFIAQ12857 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
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NFIAQ12857 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NFIAQ12857 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NFIAQ12857 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NFIAQ12857 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NFIAQ12857 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NFIAQ12857 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NFIAQ12857 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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NFIAQ12857 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NFIAQ12857 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NFIAQ12857 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NFIAQ12857 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NFIAQ12857 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NFIAQ12857 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
NFIAQ12857 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NFIAQ12857 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NFIAQ12857 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NFIAQ12857 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
NFIAQ12857 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
NFIAQ12857 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NFIAQ12857 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NFIAQ12857 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NFIAQ12857 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NFIAQ12857 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NFIAQ12857 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NFIAQ12857 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NFIAQ12857 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NFIAQ12857 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NFIAQ12857 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NFIAQ12857 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NFIAQ12857 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NFIAQ12857 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NFIAQ12857 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NFIAQ12857 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
NFIAQ12857 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NFIAQ12857 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NFIAQ12857 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
NFIAQ12857 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
NFIAQ12857 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
NFIAQ12857 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
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