Protein–RNA interactions for Protein: Q12809

KCNH2, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH2Q12809 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KCNH2Q12809 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
KCNH2Q12809 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KCNH2Q12809 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KCNH2Q12809 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KCNH2Q12809 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KCNH2Q12809 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KCNH2Q12809 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KCNH2Q12809 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KCNH2Q12809 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KCNH2Q12809 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KCNH2Q12809 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KCNH2Q12809 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
KCNH2Q12809 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KCNH2Q12809 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KCNH2Q12809 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KCNH2Q12809 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KCNH2Q12809 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KCNH2Q12809 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
KCNH2Q12809 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KCNH2Q12809 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KCNH2Q12809 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KCNH2Q12809 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KCNH2Q12809 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KCNH2Q12809 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KCNH2Q12809 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KCNH2Q12809 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KCNH2Q12809 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KCNH2Q12809 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KCNH2Q12809 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KCNH2Q12809 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KCNH2Q12809 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KCNH2Q12809 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KCNH2Q12809 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KCNH2Q12809 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KCNH2Q12809 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KCNH2Q12809 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KCNH2Q12809 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KCNH2Q12809 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KCNH2Q12809 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KCNH2Q12809 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KCNH2Q12809 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KCNH2Q12809 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KCNH2Q12809 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KCNH2Q12809 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KCNH2Q12809 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KCNH2Q12809 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KCNH2Q12809 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KCNH2Q12809 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KCNH2Q12809 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KCNH2Q12809 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KCNH2Q12809 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KCNH2Q12809 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KCNH2Q12809 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KCNH2Q12809 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KCNH2Q12809 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KCNH2Q12809 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KCNH2Q12809 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
KCNH2Q12809 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KCNH2Q12809 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
KCNH2Q12809 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KCNH2Q12809 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KCNH2Q12809 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KCNH2Q12809 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KCNH2Q12809 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KCNH2Q12809 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KCNH2Q12809 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KCNH2Q12809 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KCNH2Q12809 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KCNH2Q12809 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KCNH2Q12809 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KCNH2Q12809 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KCNH2Q12809 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KCNH2Q12809 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KCNH2Q12809 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
KCNH2Q12809 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
KCNH2Q12809 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
KCNH2Q12809 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
KCNH2Q12809 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
KCNH2Q12809 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
KCNH2Q12809 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
KCNH2Q12809 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
KCNH2Q12809 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
KCNH2Q12809 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KCNH2Q12809 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KCNH2Q12809 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
KCNH2Q12809 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
KCNH2Q12809 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
KCNH2Q12809 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KCNH2Q12809 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
KCNH2Q12809 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
KCNH2Q12809 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
KCNH2Q12809 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
KCNH2Q12809 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
KCNH2Q12809 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
KCNH2Q12809 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
KCNH2Q12809 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
KCNH2Q12809 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KCNH2Q12809 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KCNH2Q12809 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms