Protein–RNA interactions for Protein: Q12805

EFEMP1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFEMP1Q12805 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
EFEMP1Q12805 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
EFEMP1Q12805 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EFEMP1Q12805 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EFEMP1Q12805 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EFEMP1Q12805 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EFEMP1Q12805 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EFEMP1Q12805 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EFEMP1Q12805 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EFEMP1Q12805 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EFEMP1Q12805 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EFEMP1Q12805 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EFEMP1Q12805 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EFEMP1Q12805 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EFEMP1Q12805 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EFEMP1Q12805 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EFEMP1Q12805 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
EFEMP1Q12805 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
EFEMP1Q12805 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EFEMP1Q12805 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EFEMP1Q12805 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EFEMP1Q12805 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EFEMP1Q12805 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
EFEMP1Q12805 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EFEMP1Q12805 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
EFEMP1Q12805 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EFEMP1Q12805 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EFEMP1Q12805 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EFEMP1Q12805 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EFEMP1Q12805 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EFEMP1Q12805 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EFEMP1Q12805 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EFEMP1Q12805 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EFEMP1Q12805 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EFEMP1Q12805 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EFEMP1Q12805 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EFEMP1Q12805 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
EFEMP1Q12805 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EFEMP1Q12805 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EFEMP1Q12805 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EFEMP1Q12805 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EFEMP1Q12805 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EFEMP1Q12805 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EFEMP1Q12805 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EFEMP1Q12805 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
EFEMP1Q12805 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
EFEMP1Q12805 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EFEMP1Q12805 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EFEMP1Q12805 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EFEMP1Q12805 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EFEMP1Q12805 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EFEMP1Q12805 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
EFEMP1Q12805 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EFEMP1Q12805 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
EFEMP1Q12805 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EFEMP1Q12805 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EFEMP1Q12805 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EFEMP1Q12805 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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