Protein–RNA interactions for Protein: Q12800

TFCP2, Alpha-globin transcription factor CP2, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFCP2Q12800 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TFCP2Q12800 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TFCP2Q12800 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TFCP2Q12800 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TFCP2Q12800 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TFCP2Q12800 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TFCP2Q12800 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TFCP2Q12800 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TFCP2Q12800 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TFCP2Q12800 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TFCP2Q12800 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TFCP2Q12800 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TFCP2Q12800 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TFCP2Q12800 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TFCP2Q12800 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TFCP2Q12800 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TFCP2Q12800 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TFCP2Q12800 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TFCP2Q12800 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TFCP2Q12800 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TFCP2Q12800 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TFCP2Q12800 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TFCP2Q12800 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TFCP2Q12800 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TFCP2Q12800 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TFCP2Q12800 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TFCP2Q12800 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TFCP2Q12800 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TFCP2Q12800 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TFCP2Q12800 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TFCP2Q12800 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TFCP2Q12800 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TFCP2Q12800 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TFCP2Q12800 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TFCP2Q12800 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TFCP2Q12800 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TFCP2Q12800 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TFCP2Q12800 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TFCP2Q12800 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TFCP2Q12800 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TFCP2Q12800 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TFCP2Q12800 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TFCP2Q12800 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TFCP2Q12800 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TFCP2Q12800 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TFCP2Q12800 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TFCP2Q12800 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TFCP2Q12800 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TFCP2Q12800 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TFCP2Q12800 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TFCP2Q12800 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TFCP2Q12800 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TFCP2Q12800 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TFCP2Q12800 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TFCP2Q12800 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TFCP2Q12800 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TFCP2Q12800 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TFCP2Q12800 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TFCP2Q12800 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TFCP2Q12800 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TFCP2Q12800 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TFCP2Q12800 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TFCP2Q12800 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TFCP2Q12800 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TFCP2Q12800 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TFCP2Q12800 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TFCP2Q12800 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TFCP2Q12800 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TFCP2Q12800 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TFCP2Q12800 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TFCP2Q12800 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TFCP2Q12800 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TFCP2Q12800 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TFCP2Q12800 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TFCP2Q12800 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TFCP2Q12800 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TFCP2Q12800 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TFCP2Q12800 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TFCP2Q12800 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TFCP2Q12800 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TFCP2Q12800 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TFCP2Q12800 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TFCP2Q12800 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TFCP2Q12800 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TFCP2Q12800 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TFCP2Q12800 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TFCP2Q12800 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TFCP2Q12800 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TFCP2Q12800 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TFCP2Q12800 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TFCP2Q12800 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TFCP2Q12800 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TFCP2Q12800 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TFCP2Q12800 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TFCP2Q12800 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TFCP2Q12800 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TFCP2Q12800 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TFCP2Q12800 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TFCP2Q12800 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TFCP2Q12800 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms