Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC173Q0VFZ6 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC173Q0VFZ6 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC173Q0VFZ6 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC173Q0VFZ6 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC173Q0VFZ6 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC173Q0VFZ6 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC173Q0VFZ6 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC173Q0VFZ6 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC173Q0VFZ6 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC173Q0VFZ6 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC173Q0VFZ6 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC173Q0VFZ6 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC173Q0VFZ6 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC173Q0VFZ6 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC173Q0VFZ6 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC173Q0VFZ6 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC173Q0VFZ6 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC173Q0VFZ6 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC173Q0VFZ6 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC173Q0VFZ6 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC173Q0VFZ6 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC173Q0VFZ6 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC173Q0VFZ6 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC173Q0VFZ6 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC173Q0VFZ6 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCDC173Q0VFZ6 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
CCDC173Q0VFZ6 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCDC173Q0VFZ6 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCDC173Q0VFZ6 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCDC173Q0VFZ6 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC173Q0VFZ6 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC173Q0VFZ6 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC173Q0VFZ6 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC173Q0VFZ6 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC173Q0VFZ6 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC173Q0VFZ6 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC173Q0VFZ6 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC173Q0VFZ6 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC173Q0VFZ6 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC173Q0VFZ6 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC173Q0VFZ6 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC173Q0VFZ6 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC173Q0VFZ6 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC173Q0VFZ6 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC173Q0VFZ6 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC173Q0VFZ6 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC173Q0VFZ6 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC173Q0VFZ6 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC173Q0VFZ6 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC173Q0VFZ6 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC173Q0VFZ6 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC173Q0VFZ6 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC173Q0VFZ6 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC173Q0VFZ6 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC173Q0VFZ6 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC173Q0VFZ6 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC173Q0VFZ6 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC173Q0VFZ6 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC173Q0VFZ6 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC173Q0VFZ6 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC173Q0VFZ6 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC173Q0VFZ6 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC173Q0VFZ6 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC173Q0VFZ6 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC173Q0VFZ6 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC173Q0VFZ6 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC173Q0VFZ6 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC173Q0VFZ6 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC173Q0VFZ6 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC173Q0VFZ6 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC173Q0VFZ6 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC173Q0VFZ6 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC173Q0VFZ6 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC173Q0VFZ6 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC173Q0VFZ6 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC173Q0VFZ6 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC173Q0VFZ6 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC173Q0VFZ6 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC173Q0VFZ6 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC173Q0VFZ6 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC173Q0VFZ6 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC173Q0VFZ6 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC173Q0VFZ6 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC173Q0VFZ6 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC173Q0VFZ6 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC173Q0VFZ6 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC173Q0VFZ6 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC173Q0VFZ6 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC173Q0VFZ6 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC173Q0VFZ6 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC173Q0VFZ6 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC173Q0VFZ6 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC173Q0VFZ6 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC173Q0VFZ6 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC173Q0VFZ6 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC173Q0VFZ6 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC173Q0VFZ6 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC173Q0VFZ6 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC173Q0VFZ6 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms