Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GRIN1Q05586 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GRIN1Q05586 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GRIN1Q05586 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GRIN1Q05586 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIN1Q05586 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIN1Q05586 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIN1Q05586 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIN1Q05586 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIN1Q05586 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIN1Q05586 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIN1Q05586 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIN1Q05586 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIN1Q05586 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIN1Q05586 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIN1Q05586 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIN1Q05586 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIN1Q05586 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIN1Q05586 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIN1Q05586 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIN1Q05586 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIN1Q05586 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIN1Q05586 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIN1Q05586 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIN1Q05586 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIN1Q05586 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIN1Q05586 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIN1Q05586 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIN1Q05586 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIN1Q05586 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIN1Q05586 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIN1Q05586 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIN1Q05586 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIN1Q05586 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIN1Q05586 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIN1Q05586 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIN1Q05586 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIN1Q05586 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIN1Q05586 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIN1Q05586 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIN1Q05586 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIN1Q05586 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GRIN1Q05586 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GRIN1Q05586 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GRIN1Q05586 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GRIN1Q05586 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GRIN1Q05586 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GRIN1Q05586 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GRIN1Q05586 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
GRIN1Q05586 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GRIN1Q05586 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GRIN1Q05586 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GRIN1Q05586 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GRIN1Q05586 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GRIN1Q05586 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GRIN1Q05586 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GRIN1Q05586 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GRIN1Q05586 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GRIN1Q05586 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GRIN1Q05586 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GRIN1Q05586 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GRIN1Q05586 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GRIN1Q05586 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GRIN1Q05586 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GRIN1Q05586 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GRIN1Q05586 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
GRIN1Q05586 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GRIN1Q05586 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GRIN1Q05586 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GRIN1Q05586 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GRIN1Q05586 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GRIN1Q05586 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
GRIN1Q05586 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GRIN1Q05586 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
GRIN1Q05586 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GRIN1Q05586 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GRIN1Q05586 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GRIN1Q05586 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GRIN1Q05586 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GRIN1Q05586 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GRIN1Q05586 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GRIN1Q05586 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GRIN1Q05586 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GRIN1Q05586 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GRIN1Q05586 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GRIN1Q05586 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GRIN1Q05586 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GRIN1Q05586 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GRIN1Q05586 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GRIN1Q05586 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GRIN1Q05586 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GRIN1Q05586 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
GRIN1Q05586 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GRIN1Q05586 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GRIN1Q05586 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GRIN1Q05586 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GRIN1Q05586 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GRIN1Q05586 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
GRIN1Q05586 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GRIN1Q05586 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms