Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CHRNEQ04844 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CHRNEQ04844 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms