Protein–RNA interactions for Protein: Q04743

EMX2, Homeobox protein EMX2, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMX2Q04743 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EMX2Q04743 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EMX2Q04743 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
EMX2Q04743 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EMX2Q04743 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EMX2Q04743 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EMX2Q04743 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
EMX2Q04743 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EMX2Q04743 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EMX2Q04743 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EMX2Q04743 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EMX2Q04743 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EMX2Q04743 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EMX2Q04743 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EMX2Q04743 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EMX2Q04743 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EMX2Q04743 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EMX2Q04743 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EMX2Q04743 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EMX2Q04743 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EMX2Q04743 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EMX2Q04743 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EMX2Q04743 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EMX2Q04743 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EMX2Q04743 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EMX2Q04743 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EMX2Q04743 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EMX2Q04743 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EMX2Q04743 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EMX2Q04743 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EMX2Q04743 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EMX2Q04743 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EMX2Q04743 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EMX2Q04743 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EMX2Q04743 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EMX2Q04743 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EMX2Q04743 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EMX2Q04743 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EMX2Q04743 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EMX2Q04743 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EMX2Q04743 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EMX2Q04743 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EMX2Q04743 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
EMX2Q04743 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EMX2Q04743 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EMX2Q04743 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EMX2Q04743 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EMX2Q04743 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EMX2Q04743 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EMX2Q04743 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EMX2Q04743 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EMX2Q04743 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EMX2Q04743 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EMX2Q04743 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
EMX2Q04743 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EMX2Q04743 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EMX2Q04743 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EMX2Q04743 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EMX2Q04743 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EMX2Q04743 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EMX2Q04743 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EMX2Q04743 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EMX2Q04743 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EMX2Q04743 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EMX2Q04743 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EMX2Q04743 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EMX2Q04743 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
EMX2Q04743 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EMX2Q04743 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EMX2Q04743 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EMX2Q04743 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EMX2Q04743 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
EMX2Q04743 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EMX2Q04743 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EMX2Q04743 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EMX2Q04743 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EMX2Q04743 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EMX2Q04743 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EMX2Q04743 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EMX2Q04743 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EMX2Q04743 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EMX2Q04743 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EMX2Q04743 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EMX2Q04743 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EMX2Q04743 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EMX2Q04743 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
EMX2Q04743 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EMX2Q04743 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EMX2Q04743 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
EMX2Q04743 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EMX2Q04743 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EMX2Q04743 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
EMX2Q04743 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EMX2Q04743 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EMX2Q04743 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EMX2Q04743 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EMX2Q04743 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EMX2Q04743 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EMX2Q04743 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EMX2Q04743 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms