Protein–RNA interactions for Protein: Q02880

TOP2B, DNA topoisomerase 2-beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2BQ02880 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
TOP2BQ02880 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
TOP2BQ02880 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TOP2BQ02880 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
TOP2BQ02880 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
TOP2BQ02880 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
TOP2BQ02880 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TOP2BQ02880 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
TOP2BQ02880 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
TOP2BQ02880 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
TOP2BQ02880 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TOP2BQ02880 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TOP2BQ02880 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
TOP2BQ02880 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TOP2BQ02880 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TOP2BQ02880 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TOP2BQ02880 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TOP2BQ02880 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TOP2BQ02880 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TOP2BQ02880 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TOP2BQ02880 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TOP2BQ02880 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TOP2BQ02880 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TOP2BQ02880 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TOP2BQ02880 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TOP2BQ02880 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TOP2BQ02880 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TOP2BQ02880 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TOP2BQ02880 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TOP2BQ02880 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TOP2BQ02880 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TOP2BQ02880 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TOP2BQ02880 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
TOP2BQ02880 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TOP2BQ02880 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TOP2BQ02880 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TOP2BQ02880 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TOP2BQ02880 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TOP2BQ02880 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TOP2BQ02880 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TOP2BQ02880 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TOP2BQ02880 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TOP2BQ02880 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
TOP2BQ02880 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
TOP2BQ02880 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
TOP2BQ02880 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
TOP2BQ02880 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
TOP2BQ02880 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
TOP2BQ02880 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
TOP2BQ02880 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
TOP2BQ02880 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TOP2BQ02880 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
TOP2BQ02880 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TOP2BQ02880 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TOP2BQ02880 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
TOP2BQ02880 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TOP2BQ02880 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TOP2BQ02880 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
TOP2BQ02880 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
TOP2BQ02880 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
TOP2BQ02880 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
TOP2BQ02880 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
TOP2BQ02880 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TOP2BQ02880 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TOP2BQ02880 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TOP2BQ02880 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TOP2BQ02880 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
TOP2BQ02880 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
TOP2BQ02880 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
TOP2BQ02880 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
TOP2BQ02880 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
TOP2BQ02880 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
TOP2BQ02880 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
TOP2BQ02880 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
TOP2BQ02880 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TOP2BQ02880 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TOP2BQ02880 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TOP2BQ02880 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TOP2BQ02880 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TOP2BQ02880 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TOP2BQ02880 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TOP2BQ02880 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TOP2BQ02880 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TOP2BQ02880 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TOP2BQ02880 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TOP2BQ02880 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TOP2BQ02880 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TOP2BQ02880 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TOP2BQ02880 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TOP2BQ02880 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TOP2BQ02880 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
TOP2BQ02880 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
TOP2BQ02880 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TOP2BQ02880 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TOP2BQ02880 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TOP2BQ02880 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
TOP2BQ02880 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
TOP2BQ02880 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
TOP2BQ02880 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
TOP2BQ02880 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms