Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
DSG1Q02413 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
DSG1Q02413 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
DSG1Q02413 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
DSG1Q02413 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
DSG1Q02413 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
DSG1Q02413 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
DSG1Q02413 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
DSG1Q02413 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
DSG1Q02413 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
DSG1Q02413 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
DSG1Q02413 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
DSG1Q02413 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
DSG1Q02413 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
DSG1Q02413 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
DSG1Q02413 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
DSG1Q02413 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
DSG1Q02413 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
DSG1Q02413 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
DSG1Q02413 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
DSG1Q02413 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
DSG1Q02413 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
DSG1Q02413 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
DSG1Q02413 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
DSG1Q02413 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
DSG1Q02413 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
DSG1Q02413 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
DSG1Q02413 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
DSG1Q02413 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
DSG1Q02413 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
DSG1Q02413 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
DSG1Q02413 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
DSG1Q02413 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DSG1Q02413 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DSG1Q02413 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DSG1Q02413 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DSG1Q02413 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
DSG1Q02413 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
DSG1Q02413 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
DSG1Q02413 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DSG1Q02413 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
DSG1Q02413 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DSG1Q02413 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DSG1Q02413 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DSG1Q02413 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
DSG1Q02413 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
DSG1Q02413 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
DSG1Q02413 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
DSG1Q02413 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
DSG1Q02413 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DSG1Q02413 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DSG1Q02413 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DSG1Q02413 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DSG1Q02413 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DSG1Q02413 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DSG1Q02413 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
DSG1Q02413 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
DSG1Q02413 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DSG1Q02413 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DSG1Q02413 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DSG1Q02413 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DSG1Q02413 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
DSG1Q02413 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DSG1Q02413 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
DSG1Q02413 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
DSG1Q02413 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DSG1Q02413 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
DSG1Q02413 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
DSG1Q02413 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
DSG1Q02413 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
DSG1Q02413 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DSG1Q02413 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
DSG1Q02413 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
DSG1Q02413 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DSG1Q02413 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DSG1Q02413 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
DSG1Q02413 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
DSG1Q02413 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DSG1Q02413 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DSG1Q02413 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DSG1Q02413 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DSG1Q02413 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DSG1Q02413 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DSG1Q02413 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DSG1Q02413 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DSG1Q02413 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DSG1Q02413 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DSG1Q02413 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DSG1Q02413 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DSG1Q02413 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DSG1Q02413 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DSG1Q02413 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DSG1Q02413 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DSG1Q02413 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DSG1Q02413 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
DSG1Q02413 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DSG1Q02413 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DSG1Q02413 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DSG1Q02413 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DSG1Q02413 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms