Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms