Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
OTUD4Q01804 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
OTUD4Q01804 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
OTUD4Q01804 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
OTUD4Q01804 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
OTUD4Q01804 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
OTUD4Q01804 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
OTUD4Q01804 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
OTUD4Q01804 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
OTUD4Q01804 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
OTUD4Q01804 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
OTUD4Q01804 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
OTUD4Q01804 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
OTUD4Q01804 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
OTUD4Q01804 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
OTUD4Q01804 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
OTUD4Q01804 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
OTUD4Q01804 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
OTUD4Q01804 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
OTUD4Q01804 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
OTUD4Q01804 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
OTUD4Q01804 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
OTUD4Q01804 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
OTUD4Q01804 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
OTUD4Q01804 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
OTUD4Q01804 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
OTUD4Q01804 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
OTUD4Q01804 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
OTUD4Q01804 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
OTUD4Q01804 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
OTUD4Q01804 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
OTUD4Q01804 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
OTUD4Q01804 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
OTUD4Q01804 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
OTUD4Q01804 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
OTUD4Q01804 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
OTUD4Q01804 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
OTUD4Q01804 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
OTUD4Q01804 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
OTUD4Q01804 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
OTUD4Q01804 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
OTUD4Q01804 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
OTUD4Q01804 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
OTUD4Q01804 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
OTUD4Q01804 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
OTUD4Q01804 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
OTUD4Q01804 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
OTUD4Q01804 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
OTUD4Q01804 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
OTUD4Q01804 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
OTUD4Q01804 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
OTUD4Q01804 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
OTUD4Q01804 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
OTUD4Q01804 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
OTUD4Q01804 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
OTUD4Q01804 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
OTUD4Q01804 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
OTUD4Q01804 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
OTUD4Q01804 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
OTUD4Q01804 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
OTUD4Q01804 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
OTUD4Q01804 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
OTUD4Q01804 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
OTUD4Q01804 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
OTUD4Q01804 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
OTUD4Q01804 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
OTUD4Q01804 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
OTUD4Q01804 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
OTUD4Q01804 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
OTUD4Q01804 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
OTUD4Q01804 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
OTUD4Q01804 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
OTUD4Q01804 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
OTUD4Q01804 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
OTUD4Q01804 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
OTUD4Q01804 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
OTUD4Q01804 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
OTUD4Q01804 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
OTUD4Q01804 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
OTUD4Q01804 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
OTUD4Q01804 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
OTUD4Q01804 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
OTUD4Q01804 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
OTUD4Q01804 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
OTUD4Q01804 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
OTUD4Q01804 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
OTUD4Q01804 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
OTUD4Q01804 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
OTUD4Q01804 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
OTUD4Q01804 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
OTUD4Q01804 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
OTUD4Q01804 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
OTUD4Q01804 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
OTUD4Q01804 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
OTUD4Q01804 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
OTUD4Q01804 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
OTUD4Q01804 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
OTUD4Q01804 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
OTUD4Q01804 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
OTUD4Q01804 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms