Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms