Protein–RNA interactions for Protein: Q00975

CACNA1B, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, humanhuman

Predictions only

Length 2,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1BQ00975 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA1BQ00975 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA1BQ00975 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA1BQ00975 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA1BQ00975 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA1BQ00975 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA1BQ00975 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA1BQ00975 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA1BQ00975 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA1BQ00975 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA1BQ00975 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA1BQ00975 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA1BQ00975 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA1BQ00975 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA1BQ00975 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA1BQ00975 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA1BQ00975 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA1BQ00975 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA1BQ00975 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA1BQ00975 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA1BQ00975 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA1BQ00975 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA1BQ00975 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA1BQ00975 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA1BQ00975 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA1BQ00975 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA1BQ00975 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA1BQ00975 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA1BQ00975 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA1BQ00975 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA1BQ00975 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA1BQ00975 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA1BQ00975 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA1BQ00975 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA1BQ00975 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA1BQ00975 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1BQ00975 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1BQ00975 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1BQ00975 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1BQ00975 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1BQ00975 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1BQ00975 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1BQ00975 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1BQ00975 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1BQ00975 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1BQ00975 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1BQ00975 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1BQ00975 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1BQ00975 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1BQ00975 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1BQ00975 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1BQ00975 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1BQ00975 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1BQ00975 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1BQ00975 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1BQ00975 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1BQ00975 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1BQ00975 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1BQ00975 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1BQ00975 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1BQ00975 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1BQ00975 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1BQ00975 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1BQ00975 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1BQ00975 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1BQ00975 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1BQ00975 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1BQ00975 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1BQ00975 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1BQ00975 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1BQ00975 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA1BQ00975 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA1BQ00975 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA1BQ00975 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA1BQ00975 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA1BQ00975 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA1BQ00975 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA1BQ00975 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA1BQ00975 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA1BQ00975 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA1BQ00975 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA1BQ00975 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA1BQ00975 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA1BQ00975 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA1BQ00975 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA1BQ00975 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA1BQ00975 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA1BQ00975 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA1BQ00975 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA1BQ00975 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA1BQ00975 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA1BQ00975 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA1BQ00975 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA1BQ00975 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA1BQ00975 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA1BQ00975 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA1BQ00975 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA1BQ00975 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA1BQ00975 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA1BQ00975 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms