Protein–RNA interactions for Protein: Q00526

CDK3, Cyclin-dependent kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK3Q00526 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK3Q00526 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK3Q00526 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK3Q00526 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK3Q00526 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK3Q00526 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK3Q00526 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK3Q00526 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK3Q00526 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK3Q00526 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK3Q00526 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK3Q00526 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK3Q00526 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK3Q00526 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK3Q00526 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK3Q00526 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK3Q00526 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK3Q00526 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK3Q00526 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK3Q00526 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK3Q00526 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK3Q00526 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK3Q00526 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK3Q00526 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK3Q00526 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK3Q00526 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK3Q00526 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK3Q00526 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK3Q00526 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK3Q00526 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK3Q00526 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK3Q00526 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK3Q00526 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK3Q00526 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK3Q00526 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK3Q00526 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK3Q00526 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK3Q00526 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK3Q00526 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK3Q00526 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK3Q00526 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK3Q00526 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK3Q00526 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK3Q00526 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK3Q00526 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK3Q00526 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK3Q00526 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK3Q00526 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK3Q00526 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK3Q00526 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK3Q00526 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK3Q00526 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK3Q00526 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK3Q00526 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK3Q00526 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK3Q00526 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK3Q00526 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK3Q00526 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK3Q00526 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK3Q00526 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK3Q00526 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK3Q00526 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK3Q00526 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK3Q00526 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK3Q00526 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK3Q00526 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK3Q00526 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK3Q00526 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK3Q00526 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK3Q00526 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK3Q00526 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK3Q00526 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK3Q00526 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK3Q00526 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK3Q00526 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK3Q00526 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK3Q00526 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK3Q00526 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK3Q00526 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK3Q00526 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK3Q00526 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK3Q00526 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK3Q00526 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK3Q00526 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK3Q00526 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK3Q00526 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK3Q00526 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK3Q00526 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK3Q00526 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK3Q00526 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK3Q00526 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK3Q00526 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK3Q00526 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK3Q00526 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK3Q00526 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK3Q00526 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK3Q00526 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK3Q00526 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK3Q00526 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK3Q00526 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms