Protein–RNA interactions for Protein: P84074

HPCA, Neuron-specific calcium-binding protein hippocalcin, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPCAP84074 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HPCAP84074 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
HPCAP84074 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HPCAP84074 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HPCAP84074 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HPCAP84074 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HPCAP84074 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HPCAP84074 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HPCAP84074 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HPCAP84074 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HPCAP84074 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HPCAP84074 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HPCAP84074 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HPCAP84074 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HPCAP84074 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HPCAP84074 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
HPCAP84074 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HPCAP84074 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HPCAP84074 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HPCAP84074 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HPCAP84074 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HPCAP84074 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HPCAP84074 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HPCAP84074 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
HPCAP84074 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
HPCAP84074 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HPCAP84074 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HPCAP84074 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HPCAP84074 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HPCAP84074 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HPCAP84074 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HPCAP84074 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HPCAP84074 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HPCAP84074 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HPCAP84074 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HPCAP84074 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
HPCAP84074 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HPCAP84074 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HPCAP84074 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HPCAP84074 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HPCAP84074 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HPCAP84074 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HPCAP84074 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HPCAP84074 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HPCAP84074 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HPCAP84074 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HPCAP84074 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HPCAP84074 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HPCAP84074 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HPCAP84074 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HPCAP84074 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HPCAP84074 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HPCAP84074 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HPCAP84074 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HPCAP84074 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HPCAP84074 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HPCAP84074 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HPCAP84074 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HPCAP84074 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HPCAP84074 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HPCAP84074 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HPCAP84074 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HPCAP84074 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HPCAP84074 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HPCAP84074 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HPCAP84074 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HPCAP84074 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
HPCAP84074 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HPCAP84074 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HPCAP84074 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HPCAP84074 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HPCAP84074 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HPCAP84074 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HPCAP84074 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HPCAP84074 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HPCAP84074 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HPCAP84074 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
HPCAP84074 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HPCAP84074 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HPCAP84074 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HPCAP84074 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HPCAP84074 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HPCAP84074 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HPCAP84074 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HPCAP84074 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HPCAP84074 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HPCAP84074 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HPCAP84074 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HPCAP84074 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HPCAP84074 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HPCAP84074 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
HPCAP84074 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HPCAP84074 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HPCAP84074 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HPCAP84074 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HPCAP84074 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HPCAP84074 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HPCAP84074 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HPCAP84074 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HPCAP84074 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms