Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMF1P82094 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMF1P82094 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMF1P82094 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMF1P82094 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMF1P82094 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMF1P82094 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMF1P82094 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMF1P82094 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TMF1P82094 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMF1P82094 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMF1P82094 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMF1P82094 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMF1P82094 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMF1P82094 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMF1P82094 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMF1P82094 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMF1P82094 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMF1P82094 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMF1P82094 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMF1P82094 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMF1P82094 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TMF1P82094 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMF1P82094 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMF1P82094 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMF1P82094 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TMF1P82094 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TMF1P82094 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMF1P82094 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMF1P82094 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMF1P82094 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMF1P82094 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMF1P82094 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMF1P82094 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMF1P82094 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMF1P82094 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMF1P82094 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMF1P82094 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMF1P82094 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMF1P82094 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMF1P82094 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMF1P82094 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMF1P82094 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMF1P82094 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
TMF1P82094 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TMF1P82094 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TMF1P82094 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TMF1P82094 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TMF1P82094 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TMF1P82094 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TMF1P82094 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TMF1P82094 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TMF1P82094 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TMF1P82094 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TMF1P82094 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TMF1P82094 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TMF1P82094 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TMF1P82094 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMF1P82094 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMF1P82094 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMF1P82094 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMF1P82094 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMF1P82094 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMF1P82094 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMF1P82094 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMF1P82094 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMF1P82094 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMF1P82094 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TMF1P82094 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMF1P82094 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMF1P82094 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMF1P82094 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMF1P82094 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMF1P82094 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMF1P82094 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMF1P82094 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMF1P82094 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMF1P82094 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMF1P82094 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMF1P82094 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMF1P82094 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TMF1P82094 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMF1P82094 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMF1P82094 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMF1P82094 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMF1P82094 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMF1P82094 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMF1P82094 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMF1P82094 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMF1P82094 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMF1P82094 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMF1P82094 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TMF1P82094 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMF1P82094 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMF1P82094 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMF1P82094 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMF1P82094 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMF1P82094 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TMF1P82094 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TMF1P82094 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms