Protein–RNA interactions for Protein: P78348

ASIC1, Acid-sensing ion channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC1P78348 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ASIC1P78348 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms